Əlirza Ağabəyli 1996-2002 ci illərdə Azərbaycan Tibb Universitetinin I müalicə profilaktika faklütəsində təhsil almışdır. 2002-2003 cü illərdə 1 saylı Kliniki Tibbi Mərkəzdə internatura keçmiş, 2007-2012 ci illərdə Türkiyənin İstanbul Çapa Tibb fakültəsində və Koşuyolu eğitim ve araşdırma xəstəxanasının kardiologiya şöbəsində ixtisasartırma kursu keçmişdir. Hal-hazırda HB Güven klinikasının Kardiologiya şöbəsində fəaliyyət göstərir.